木質托盤熏蒸現在主要有兩種處理方法：熱處理和用溴甲烷熏蒸。
對于熱處理，木質包裝箱處理時，其木材中心溫度應達到56OC，并且至少保持30分鐘。
對于熏蒸，木質包裝必須在密閉地方，于規定的溴甲烷劑量下熏蒸至少16小時，然后置于通風處，使其熏蒸劑的濃度降到安全濃度以下。
在上面任何一種處理后，在濟南木包裝箱包裝每件商品的可視位置上，最好是在每件商品的正反兩面，標上一個清晰和永久的標記，此標記需要受到國際植物保護公約的認可，以證明木質包裝進行了規定的處理。一個標記必須包括IPPC專用標志，ISO標準的國家代碼，由該國植物保護機構頒發給木質包裝生產商的唯一性的數字，和代表處理方法的字母縮寫。免熏蒸托盤產品一般符合世界各國的入境和環保要求，無需任何手續便可以直接在進口國通關。
免熏蒸木質托盤(消毒)方式，有使用藥物和熱處理兩種方式，使用藥物為：溴甲烷、環氧乙烷
1、把要熏蒸木箱的貨物堆碼整齊，用苫布蓋好，四邊壓實，使之密封，但要留出一角做投藥口。
2、在苫布下、貨物旁放一盆清水，把藥投入水中
3、把預留的投藥口壓實，使需要熏蒸木箱的貨物處于完全密封狀態下保持24小時
4、打開苫布通風，待毒氣散盡即可移動貨物，大概18-24小時
5. 開出免熏蒸木箱(消毒)證書。
